Инфламмасомы являются причиной возникновения аутоиммунных заболеваний. Нарушения в регуляции инфламмасом связаны с рядом аутоиммунных заболеваний. Токсоплазма Гондии является одним из факторов, активирующих инфламмасомы и вызывающих развитие аутоиммунных заболеваний. Научные исследования подтверждают эту связь.